Service spécialisé dans la production des vidéos d’Al Qaïda, Al-Sahab a rendue publique le 12 avril 2006 un entretiende 28 minutes avec Ayman al-Zawahiri; mais cet enregistrement remonte à novembre 2005. Il y exprime notamment son soutien pour « notre frère, Abu Musab al-Zarkawi ». Les interventions de Zawahiri sont devenues bien plus nombreuses que celles d’Oussama ben Laden. Selon une analyse de Craig Whitlock publiée dans le Washington Post (16 avril 2006), celles-ci révèlent cependant une crainte de perdre le contrôle idéologique du mouvement jihadiste mondial, au développement duquel le médecin égyptien a consacré sa vie. Selon d’anciens militants islamistes qui l’ont connu, cela expliquerait pourquoi il prend position sur toute une série de thèmes, bien qu’il soit probable qu’il se trouve en mesure d’exercer une réelle influence sur tous ces terrains. Zawahiri et Zarkawi seraient beaucoup moins proches que Zawahiri ne le laisse croire, bien que la nature de leurs relations continue d’être un sujet de débat parmi les experts. Il est en revanche certain que les succès électoraux de groupes islamistes comme le Hamas en Palestine, avec l’acceptation de participer à un système politique qui n’est pas fondé sur les principes islamistes, font craindre à Zawahiri que ces mouvements rassemblent derrière eux les masses musulmanes du Moyen-Orient, les détournant de la voie prônée par les groupes jihadistes liés à Al Qaïda. Selon un ancien compagnon de cellule de Zawahiri, le monde change, mais le jihadiste égyptien, pour sa part, reste toujours le même – « hormis quelques cheveux blancs ».
